斑点叉尾鮰3 ～5 龄达到性成熟，最适宜的繁殖温度为21 - 26 ℃ 。在自然条件下，多选择僻静、阴暗的岩石下或凹形洞穴筑巢产卵，亲鱼有护巢习性。卵黄色，产出后形成胶质卵块，卵径3 . 5 ～4 . 0 毫米，在24 ℃ 左右时，孵孵化期为6 ～7 天，刚孵出的仔鱼全长10 毫米左右，在水底停留2 ～ 3 天后开始游至表层摄食。亲鱼怀卵量一般在7000 ～8000 粒／千克。自然受精率可达90 ％以上，人工孵化率在80 ％以上。