泥鳅苗种最好进行专池培育，专池培育易管理、成活率高。培育池的面积不宜过大，一般以40 ～60 平方米为宜。池底最好有20 厘米厚的松软的泥土，如果在泥土中混有腐殖土更适于泥鳅的生长，因为这种土有利于泥鳅的天然饲料如水蚤、丝蚯蚓等水生动物的生长和繁殖。在鱼苗下塘前半个月左右，排干苗种培育池水进行消毒、曝晒，下塘前一周注人新水，并施人少量粪肥，毒性消失后放入泥鳅苗。
泥鳅苗放养密度随放养时间不同而异，一种是当泥鳅苗孵出3 天，孵黄吸收完能游动摄食后分池放养；一种是泥鳅苗孵出10 - 15天，鱼体长1 厘米左右时，分池放养，一般放养密度为每平方米800 ～1000 尾。还有一种是当泥鳅苗体长达3 厘米以上时，进行分池培育，放养密度为每平方米50 ～100 尾。放养时，要进行筛选，防止大小规格不齐，造成大鱼吃小鱼。
泥鳅苗对饲料的质量要求较高，除进行施肥培肥水质外，还应人工投喂蛋黄、奶粉、鱼粉、豆饼粉等饲料。泥鳅苗孵出3 天后，全长只有3 ～4 毫米，其个体和口均小，只能吃轮虫、蛋黄、奶粉等，当全长达8 毫米时，才能吃普通大的水蚤。随着泥鳅苗的的个体逐渐长大，可以投喂煮熟的米糠、麦熬、豆饼粉等，最好能在此时拌些动物性饲料。投饲量开始时每日投喂占放养总体重的2 ～5 % ，以后随苗种的生长，日投饲量可增加到放养总体重的10 ％。每日投喂2 ～3 次。施肥的方法是，在水温低的情况下，每100 立方米的水体每次施速效性硝酸按200 克左右；在水温较高的情况下，每100 立方米的水体每次施尿素250 克左右，一般隔天施一次，连续施2 ～3 次，以后视水质肥度进行追肥。在施化肥的同时，结合施有机肥效果更佳。苗种培育期除充分供应适宜的饲料外，还应管理好水质。水质良好时，泥鳅苗在水底游动索食，水质变坏时，泥鳅苗游到水的中上层，发现这种变化时，应赶快换水。水质良好而饲料不足时，泥鳅苗也会离开水底，但游动活泼，只是部分苗有这种行动，故容易区别。特别在泥鳅苗孵化后半个月左右，在开始进行肠呼吸之前，如水中溶氧不足，常会在一夜之间全部死亡。